Perusopetusta annetaan Haapajärvellä yläasteella, K.J. Ståhlbergin koululla, Oksavan, Parkkilan, Tiiton ja Väliojan kouluilla. K.J. Ståhlbergin koulun yhteydessä toimii kehitysvammaisten opetus- ja päivähoitoyksikkö (harjaantumisopetus) ja pienryhmäopetus. 7.- 9. vuosiluokkien erityisoppilaat on pääosin integroitu yleisopetuksen ryhmiin. Koululaisten aamu- ja iltapäivätoiminta järjestetään erillisen suunnitelman mukaisesti K.J. Ståhlbergin koululla. Perusopetuksen valmistavaa opetusta annetaan Haapajärven yläasteella.